自九十一年二月起，由骨科權威醫師吳濬哲擔任董事會執行長兼院長，延攬各大醫院的知名骨科醫師加入康寧醫院的服務行列中，並成立骨科醫療團隊，積極推動本院轉列為以骨科發展為主的綜合性醫院。     九十二年三月十七日董事會改選，聘請著名外科權威許文憲長老擔任院長。積極引進基督徒醫療及管理團隊，在已有的優良醫療基礎上，更進一步成為一個嶄新的負有醫療傳道使命的醫院。       九十三年三月本院與敏盛體系合作，由楊弘仁醫師任院長，陳國團先生任執行長，同時引進敏盛醫療團隊於本院駐診。九十四年二月於楊院長回任敏盛後，即由陳國團先生行長兼院長一職。       九十五年十二月一日前三軍總醫院院長張聖原醫師接任院長，本院與三總醫療合作更進一步，多項轉診及教學研究持續進步。       九十七年十月十六日張院長應北市郝龍斌市長之邀接任北市聯合醫院總院長，院長職由副院長尹長生醫師接任。尹醫師於康寧開院之始即在院服務，是婦產科專家醫師，以服務女性醫學卅餘年之經驗，認為以婦幼為主的家庭照護，可延伸至整個社區，這才是本院服務社區的原則。     康寧醫院設立於內湖區的葫洲里，在大湖與東湖之間，位於台北市內湖區成功路五段底的康寧生活圈。醫療服務範圍以內湖、南港、汐止地區的民眾為主，自九十一年起陸續成立腫瘤治療中心、心臟醫學預防保健中心等，目的是為提昇服務鄉親的品質，並成為社區民眾健康的守門員。